福建在全国首推“一张证书、两岸互认”，通过在平潭试点采信台湾认证结果和检验检测结果，全年共采信台湾进口产品认证证书135批、检测结果1169批。开展两岸检验检疫证书电子信息互传互换互查，实现台湾产品检验检疫证书通过两岸检验检疫数据交换中心即传即报。
对台湾地区输大陆食品农产品，试行“源头管理、口岸验放”工作模式。对平潭小额贸易商品交易市场销售的台湾进口水果，实施“边抽样检验、边上架销售”模式，实现了水果“上午采摘，下午上架销售”。对原产于台湾的预包装食品、化妆品，实施“快审快核”的标签审核模式，审核内容简化约9成，审核时限由原来约7天减短为1天。
在平潭建立海西隔检中心项目是国务院重点支持福建经济发展的重大项目之一，该局与平潭综合实验区管委会举行检地合作签约仪式，海西隔检中心进入全面建设阶段。该项目建成后，平潭口岸将成为质检总局优惠政策和先行先试政策的承接平台、地方产业的孵化器和产业发展的助推器、两岸农业经贸合作交流的新平台。
