为不断提高机采棉采收质量，昌吉州积*走出去学习兵团种植经验，选择适合本地气候条件的早熟品种(如新陆早57号、61号、72号等)，推广应用卫星定位导航自动驾驶技术、双膜覆盖、化学打顶等先进技术，全方位开展农机农艺技术融合。依托昌吉州农业首席专家制度，成立棉花首席专家组，农业、农机专业技术人员共同指导机采棉生产技术环节，有效保障了昌吉州棉花生产水平的提高。2017年制定出台了昌吉州棉花生产全程机械化作业技术规程，并加以大力推广实施，对提升昌吉州机采棉种植水平，起到了巨大的推动作用。
2018年，为进一步推进棉花供给侧结构性改革深入开展，探索新形势下棉花节本增效新模式，昌吉州在2017年开展棉花供给侧结构性改革试点工作的基础上，继续在玛纳斯县进行棉花供给侧结构性改革试点，带动昌吉州西部县市优质棉生产基地全产业链提质增效，全面提升棉花品质、植棉收益和市场竞争力。试点工作将从推进棉花单品种植、适度规模经营、实施标准化种植、优化轧花工艺流程、形成产加销一体化利益联结机制和棉花优质优价机制等方面入手，破解棉花全产业链发展难题，探索棉花提质节本增效路径。
