棉花剥取短绒后，再用破壳机脱壳，100公斤棉花可得棉花壳40公斤。棉花壳含多缩戊糖22％～25％，纤维素37％～48％，木质素29％～32％，是多种用途的化工原料，可生产糠醛、丙酮、丁醇、酒精、甘油、醋酸、乙酰丙酸、植物激素、活性炭等。
近年来，棉花壳主要用于培养食用菌，它是理想的天然综合培养基，经加水浸泡、高压灭菌、接种培养，100公斤棉花壳可生产鲜猴头、鲜平菇100公斤，或鲜木耳70公斤～80公斤，或鲜草菇30公斤～45公斤，或干灵芝10公斤～15公斤，或干银耳3公斤～4公斤。每公斤棉花壳生产食用菌的产值*高的可达5元以上。
生产食用菌后的棉花壳残渣，含有大量菌丝体，是优良的饲料和肥料，也可作沼气池的填料。
