网格化监管工作重点在基层，具体实施也在基层，因此《意见》特别强调食品安全网格化监管工作要以县（市、区及以下为重点。构建的食品安全监管三级网格一级以县（市、区为单元建立，各县（市、区人民政府为责任主体；二级网格以乡镇（街道为单元建立，各乡镇人民政府（街道办事处为责任主体；三级网格以村（社区为单元建立，各村（社区委员会为责任主体，通过县、乡、村三级网格化监管筑牢基层监管“网底”。
此外，《意见》指出，要搭建信息平台，加大资源整合力度，建设食品安全监管综合信息平台，涵盖基础信息、责任划分、许可备案、监督检查、执法办案、应急处置、投诉举报、视频监控等多种功能，并加强与省市级食品安全监管信息平台、本级社会综合治理网格化信息平台的对接。
