《意见》按照《中共中央关于全面推进依法治国若干重大问题的决定》和《法治政府建设实施纲要（2015~2020》的要求，结合食品药品监管执法实际，从强化责任担当、完善权责清单、规范执法程序、推进阳光执法、严格行刑衔接、预防职务犯罪等方面，明确了食药监管部门严格依法履职的基本责任和义务。
《意见》明确了追究原则、追究范围，细化规定了食品药品监管部门及其执法人员应当承担行政责任的12种责任追究情形、6种从重责任追究情形、3种从轻或者减轻责任追究情形、8种免责情形。
《意见》规定，食品药品监管部门及其执法人员有下列情形之一的，应当承担行政责任：未按照法定条件及程序实施行政许可，或者超越法定职权予以行政许可的；未按要求进行监督检查或者监督检查流于形式，造成不良后果的；经风险评估或者抽样检测得出不安全结论后，未及时采取相应监管措施，造成食品药品安全事故或者不良社会影响的；未依法履行信息公开职责，造成不良后果的；未依法处理食品药品投诉举报，造成不良后果的；对发现的违法行为、安全隐患等问题未及时处理，造成不良后果的；瞒报、谎报、迟报食品药品安全事故的；接到食品药品安全事故报告未及时处理，造成事故扩大或者蔓延的；滥用行政裁量权或者选择性执法，不按规定查处食品药品违法行为的；对涉嫌危害食品药品安全犯罪案件，未依法移送公安机关处理的；无正当理由，不履行或者拖延履行上级交办的工作的；其他应当追究责任的情形。
食品药品监管部门及其执法人员有下列情形之一的，应当从重追究责任：参与、包庇或者纵容食品药品安全违法犯罪行为的；在责任调查过程中弄虚作假，隐瞒事实真相，干扰、阻碍责任调查的；对申诉人、投诉人、检举人、控告人实施打击、报复、陷害的；通过行贿等方式谋求减责、免责的；伪造、隐匿、毁灭证据或者教唆、帮助行政相对人伪造、隐匿、毁灭证据的；其他应当依法从重追究责任的。
食品药品监管部门及其执法人员有下列情形之一的，可以从轻或者减轻责任：主动采取补救措施，消除不良影响或者有效阻止危害后果发生的；主动承认错误，积*配合责任案件调查的；其他依法可以从轻、减轻追究责任的。
食品药品监管部门及其执法人员有下列情形之一的，可以免除责任：按照法律、法规、规章规定，或者年度监督检查计划、“双随机”抽查安排，已履行监督检查职责的；因现有科学技术水平的限制不能发现所存在问题，导致食品药品安全问题无法定性的；因不能预见、不能避免且不能克服的不可抗力因素，导致食品药品监管部门及人员未能依法履行职责的；已依法对行政相对人作出责令整改或者停产停业整顿的决定，行政相对人逃避检查，擅自违法生产经营的；因食品药品检验、鉴定、认证等中介机构或者食品药品许可申请人出具虚假报告等，导致错误判定或者处理的；对拒不执行行政处罚决定者，已依法申请人民法院强制执行，被执行人逃避检查，违法生产经营的；违法、不当行政行为情节轻微并及时纠正，未造成不良后果或者不良后果被及时消除的；其他依法不应当追究责任的。
《意见》规定了批准行政行为、内设机构、集体研究决定、执法人员、执行上级决定的行政责任划分的具体标准。
《意见》确定了责任追究的方式、依法调查处理、作出决定和送达、保障当事人申辩权和申诉权等责任追究的具体程序。
《意见》强调，要加强组织领导，加强人员、经费和装备保障，加强队伍建设，加强舆论宣传，认真做好依法行政履职尽责工作。
