一、病害
总体偏轻发生(2级)，局部中等(3级)，发生面积526万亩次，以苗期病害、黄萎病、枯萎病为主。
苗期病害偏轻发生(2级)发生面积200万亩，发生区在伊犁、塔城、博州、昌吉，其中昌吉中等发生(3级)。铃期病害轻发生(1级)，发生面积37万亩。主要发生区喀什、博州、塔城、昌吉，其中昌吉中等发生(3级)。黄萎病中等发生(3级)，发生面积132万亩，主要发生区在塔城、博州、哈密。枯萎病偏轻发生(2级)，发生面积73万亩，发生区在喀什、巴州、塔城、昌吉、阿克苏。红叶茎枯病轻发生(1级)，发生面积39万亩，主要发生区塔城、博州、昌吉。棉花早衰轻发生(1级)，发生面积45万亩，主要发生区域在塔城、博州、昌吉，其中昌吉偏轻发生(2级)。
二、虫害
总体中等发生(3级)，局部偏重(4级)，发生面积152 0173 3840万亩次。
棉铃虫偏轻发生(2级)，发生面积417万亩次。一代轻发生(1级)，发生面积35万亩，发生区域主要在阿克苏、塔城、昌吉。二代偏轻发生(2级)，发生面积215万亩，阿克苏、和田、塔城、昌吉中等发生(3级)。三代偏轻发生(2级)，主要在阿克苏、塔城、昌吉州发生，发生面积167万亩。
棉叶螨中等发生(3级)，哈密、和田局部偏重发生(4级)，发生面积499万亩次。
棉蚜中等发生(3级)，发生面积521万亩次。预计苗蚜偏轻发生(2级)，仅和田、喀什、阿克苏、克州、吐鲁番局部棉区中等发生(3级)，发生面积224万亩次;伏蚜中等发生(3级)，发生面积297万亩次。
烟粉虱偏轻发生(2级)，吐鲁番市偏重发生(4级)，发生面积83万亩次。主要发生区域在和田、喀什、克州、吐鲁番、哈密。
棉盲蝽轻发生(1级)，发生面积132万亩次。一代轻发生(1级)，发生面积26万亩，发生区域主要在巴州、塔城、博州。二代偏轻发生(2级)，发生面积64万亩，主要发生区域在喀什、塔城、博州、昌吉州，其中昌吉州玛纳斯县局部棉区中等发生(3级)。三代偏轻发生(2级)，发生面积39万亩，主要发生区域在喀什、阿克苏、塔城、昌吉。四代轻发生(1级)，发生面积3万亩，主要发生区域在吐鲁番。
棉蓟马偏轻发生(2级)，主要发生区在和田、喀什、巴州、昌吉，发生面积106万亩。
其他虫害偏轻发生(2级)，发生面积150万亩次。其中地老虎中等发生(3级)发生面积22万亩。
三、预测依据：
1.越冬基数。2016年秋季调查，和田、喀什、塔城棉区棉铃虫越冬基数高于上年，其他地区略偏低(见表1)。
棉蚜埋墩石榴上越冬基数较历年偏低，如：阿克苏地区有蚜枝率76.7%，平均蚜量13.3头/15cm枝条(2015年分别为86.7%和30.1头/15cm枝条)；喀什麦盖提县平均蚜量82头/15cm枝条，比历年平均值低69%(历年值264.7头/15cm枝条)。塔城沙湾县平均蚜量0.85头/15cm枝条(2015年1.1头/15cm枝条)，室内有蚜盆率2.8%(2015年3.2%)。棉叶螨后期田间有一定虫口基数(见表2)。烟粉虱越冬基数偏高，吐鲁番秋季温室蔬菜平均有虫株率****，略高于去年的62%；平均有虫株率50%。
2.气象条件。2016年入冬偏晚，利于害虫安全越冬，若春夏季气温偏高、降水偏少，有利于棉铃虫、棉蚜、棉蓟马等害虫的繁殖为害；若7-8月出现阶段性高温、干旱将有利于棉叶螨发生。如遇春季持续低温多雨，苗期病害在北疆棉区局部有偏重发生的可能。
3.作物布局与耕作制度。设施农业面积较大，为烟粉虱等害虫提供了越冬场所；滴灌技术的推广使秋翻冬灌面积减少，有利于害虫安全越冬；田埂地头杂草防除不彻底，有利于棉叶螨发生；加工番茄、小麦、复播玉米、蔬菜、果树等寄主多样性，为棉铃虫、棉叶螨转主危害提供了有利条件;高密度栽培模式的推广以及套种面积增加为害虫发生创造了有利条件。
4.栽培品种。经过多年种植，主栽品种抗(耐)病性不强，导致黄萎病逐年加重；棉区多年连茬种植，土壤菌量大；部分棉区实施秸秆还田，利于枯黄萎病的发生。种子包衣技术的推广，一定程度上减轻了苗期病虫害的发病率，提高了植株的抗病性。
