近几年关于转基因的争议不断，作为农业大学校长，被人问起转基因方面的问题时，他通常总是说5点：**，转基因技术*为重要，潜力巨大；第二，“转基因产品”是否安全，不能一概而论，要看转的是什么基因。这有点像蘑菇，有的能吃，有的不能吃。所以，政府要进行监管审定；第三，“ 转基因食品”是经过科学检验、政府审定批准生产上市的，相当于超市里的蘑菇，是安全的；第四， 美国是转基因食品消费*早、*多的国家，从来没有发生过任何安全问题，其他国家也没有；第五，世界上与食品安全有关的所有权威机构，包括世界卫生组织、联合国粮农组织、美欧日的食品安全监管部门、各国的科学家学会组织等，都对已经上市的转基因食品的安全没有争议。
柯炳生说，在现代农业技术体系中，生物技术占据着非常重要的地位，在增加产量、改善质量、减少投入、提高效益等方面，具有巨大的潜力。对于转基因这样的新技术，普通老百姓有各种各样的疑虑，是很正常的。柯炳生表示，近年来，转基因的科普工作有不少进展，已经有越来越多的人对转基因问题有了理性认识。继续加强科普工作很重要。不过，比科普更重要的，可能还是在科研方面。
柯炳生表示，我国现在的市场上，与转基因有关系的食品也就是木瓜以及一些大豆油和菜籽油。对于农业院校包括中国农业大学来说，*重要的任务，是努力进行自主创新，要在生物技术方面取得突破，取得安全的有优良特性的转基因新品种，并在经过了严格的安全检验审批之后，用到生产中去。
