有机肥是用有机物质(含碳元素的化合物)作为肥效来源的肥料。近年来继“化肥使用量零增长行动方案”的实施以及“土十条”、“果菜茶有机肥替代化肥行动”、等政策陆续出台，均鼓励使用有机肥。而在生产、经营中不知道如何区分有机肥或生物有机肥的优劣，常规经验更多只是通过外观来区分，准确性很差，甚至会造成损失。
“复合肥看养分，有机肥看原料”也是有一定道理的，目前市面上流通的有机肥的原料品类较多，质量更是好坏不一，实际的使用效果差别很大。常见的有机肥原料有腐植酸、城市污泥、纸厂纸泥、木质素、生化制药厂的废弃物以及饼粕等。以腐植酸类为原料的有机肥对土壤和根系有一定的保护和改良作用，但对土壤里有益菌的支持作用很少，因此在肥料品质上表现一般。以城市污泥、纸厂纸泥为原料的有机肥重金属含量会比较高，如果在处理过程中不小心遗漏，会造成作物的大面积污染，造成损失。木质素类原料的有机肥虽然有机质含量较高，但是但由于木质素在土壤中分解很困难，肥效也是差强人意。农业部种植业管理司对有机肥提出的标准《NY525-2012有机肥料》强制标准，对有机肥营养相关和卫生相关的指标提出了要求：
养分相关的指标：有机质，总养分（氮、磷、钾），水分，pH。卫生相关的指标：重金属（铅、汞、砷、镉、铬）、粪大肠菌群数、蛔虫卵死亡率。试验所使用的仪器主要有凯氏定氮仪和分光光度计等。
其余有机肥检测的相关标准还有：NY884-2012生物有机肥HG/T5332-2018腐植酸生物有机肥NY/T1868-2010肥料合理使用准则有机肥料NY/T300-1995有机肥料速效磷的测定NY/T301-1995有机肥料速效钾的测定NY/T302-1995有机肥料水分的测定NY/T303-1995有机肥料粗灰分的测定NY/T304-1995有机肥料有机物总量的测定NY/T3167-2017有机肥中类药物含量的测定液相色谱-串联质谱法
