喀什、巴楚、伽师、岳普湖等地棉花经纪人交售的籽棉，棉企不仅采取磅前取样，还增加了卸车过程中随机取样，一旦衣分、长度等指标相差较大，则直接协商扣款或装车退回；对籽棉“三丝”的要求更加严格，特别是蛇皮袋、地膜及其它采摘过程中造成的异纤实行“零容忍”，坚决不允许入厂；考虑到衣分同棉纤维长度、强力等指标成反比，对43%及以上衣分籽棉谨慎收购，检验员一般现场测量棉纤维长度，对26mm及以下长度籽棉降价或拒收。除此以外，棉企还要求伏前桃、中期花、霜后花分开交售，不能混掺在一起导致籽棉、皮棉品质一致性下降。
9月15日以来，南疆沙雅、阿瓦提、巴楚、麦盖提地籽棉收购价逐渐趋稳，衣分40%、水分13%以内的籽棉定价5.70-5.80元/公斤，西大桥、阿拉尔等地区因棉花资源与加工能严重不对称，收购价格较其它棉区略高0.05-0.10元/公斤。库尔勒尉犁、普惠及北四县衣分40%的籽棉收购价5.50-5.60元/公斤，但因棉花加工企业大多采取5.20元/公斤保底式收购，因此实际结算价并没有形成。
一些轧花企业认为，2015/16年度南疆中期花的产量、品质同预期有较大差距，且9月下旬农发行、信用社及其它商业银行贷款将陆续发放，棉企将会集中开秤收购，籽棉交售价或再次小幅上涨，衣分40%的籽棉不排除冲上6元/公斤的可能。
