但是，进口糕点饼干、粮食制品、乳品、肉类、蜂蜜等食品问题仍然存在，不合格原因主要是微生物超标、添加剂不符合要求、农兽残超标等。检验检疫部门对所有涉及质量安全卫生项目不合格进口食品均按规定采取了销毁、退运等处理措施，有效保障了人民身体健康和生命安全。
2016年5月，南京检验检疫局检验发现一批重约467千克、货值5230美元的进口德国小米米粉和大米米粉（婴幼儿谷物辅助食品锌、铁、钙、维生素A、维生素D等含量明显低于《食品安全国家标准 婴幼儿辅助类食品》（GB10769-2010中规定的基本营养成分指标要求，立即对该批食品作退运处理。去年5月，张家港某代理公司申报2批阿根廷进口葵花籽原油，经张家港检验检疫局综合技术中心检测，结果显示溶剂残留项目超标，不符合食品安全国家标准《食用植物油卫生标准》（GB2716-2005规定的限量要求，涉案货重、货值高达5000吨、400万美元的葵花籽原油被退运。
从2015年1月到去年底，原产韩国的每日乐汉江牧场系列调制乳共从连云港口岸进境 81批次，货物总重189.54吨，货值33.04万美元。连云港检验检疫局共发现不合格调制乳22批次，包括违规添加、微生物不合格、贮存、运输温度不符合要求等，都进行了退运或销毁处理，有效保障了进口食品的安全。
江苏检验检疫局进口食品监管部门负责人介绍说，江苏进口食品质量总体向好，主要得益于监管方式改革，近年来，该局大力推动进口食品集中监管，落实进口食品国家监督抽检计划，组织制订了《进口食品口岸检验检疫监督管理作业指导书》。全省共建成进口肉类指定口岸6个、进口冰鲜水产品指定口岸3个，进口食品查验场所24个，进口食品指定储存场所45个，认可储存场所90个，全面实现了江苏进口食品集中监管，大大提高了质量把关成效。
此外，江苏检验检疫局还建立完善进口食品质量共治格局，持续巩固与省农委、省海洋与渔业局业的良好合作，强化与食药部门在进口食品及其市场主体、食品生产企业、不合格出口食品、保健食品化妆品、食品认证等方面的协同监管，推动实现“信息互换、监管互认、执法互助”. 去年6月3日与美国驻沪领馆、美国家禽协会联合在苏州举办进口肉类企业座谈会，中美双方官方代表、协会和企业代表共80余人共同研究进口食品政策法规、风险防范。10月在苏州高新区对进口肉类检验检疫政策和苏州进口肉类指定口岸相关优惠政策进行解读。还开展“进口食品安全社区行”主场活动，专门制作检验检疫工作微电影，编写进口食品安全主题相声，派专家参加“国检志愿者进南图”活动，进行进口食品安全知识宣讲，提高消费者质量安全意识，共同做好进口食品质量把关。
