饲料、饲料添加剂中含有大量的有益菌（乳酸菌、双歧杆菌、芽孢杆菌）、复合酶等，作为饲料进入畜禽体内后，能迅速繁殖，一方面投入菌种的代谢物中和肠内毒素，抑制了其它有害菌的生长，另一方面在宿主体内形成了正常微生物菌群，为宿主合成主要的维生素，提供营养和阻止致病菌的入侵。其有毒有害物质（如六六六、，重金属等）化学性质稳定，不易分解，残留期长，通过饲料原料对饲料的污染*为严重。因此，对饲料、饲料添加剂生产企业来说，
| 检测项目
| 项目内容
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微生物
| 微生物
| 细菌总数、霉菌数、酵母菌数、放线菌数、细胞数、
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有益微生物
| 乳酸菌、嗜酸乳杆菌、芽孢杆菌、枯草芽孢杆菌、地衣芽孢杆菌、双歧杆菌、粪肠球菌、酿酒酵母、光合细菌等
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有害微生物
| 沙门氏菌、志贺氏菌、大肠菌群、粪大肠菌群、大肠杆菌、副溶血性弧菌、金黄色葡萄球菌、溶血性链球菌、产气荚膜梭菌、蜡样芽孢杆菌、单核细胞增生李斯特氏菌、铜绿假单胞菌等。
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生物毒素
| 黄曲霉毒素B1、呕吐毒素（DON）
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常规理化
| 感观（外观及气味）、粒度、水分、灰分、pH、粗脂肪、粗纤维、盐分、粗蛋白、水溶性氯化物、挥发性盐基氮（TVBN）、混合均匀度、胃蛋白酶消化率、、亚盐、等
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重金属
| 铅、铬、镉、汞、砷、等
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农药残留
| 六六六、、
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| 、克伦特罗、沙丁胺醇
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核苷酸
| GMP、AMP、GMP、UMP、IMP
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硝基呋喃
| AMOZ、SEM、AHD、AOZ
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微量元素
| 钙、铜、铁、镁、锰、锌、硒、氟等
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维生素
| d-生物素、维生素D3、维生素E、维生素K3、维生素A、维生素B1、B2、B12、烟酸、叶酸、泛酸、
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氨基酸
| 赖氨酸、蛋氨酸、亮氨酸、异亮氨酸、苏氨酸、缬氨酸、色氨酸、苯丙氨酸、谷氨酸、丙氨酸、甘氨酸、天门冬氨酸、胱氨酸、脯氨酸、丝氨酸和酪氨酸等
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菌种鉴定
| 细菌、霉菌、酵母菌、放线菌
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电镜检查
| 透射电镜、扫描电镜等
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菌群多样性分析
| PCR-DGGE、ARDRA分析等
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