海南检验检疫局大力探索科技管理新方法，不断强化目标管理、项目精细化管理，推动了科技工作提质增效。
创新目标管理。实行目标倒逼机制，细化岗位职责和岗位要求，明确阶段性目标任务的时间节点；制定每月任务清单，实行台账式管理，领导干部带头认领任务。实行经费使用目标管理，建立项目主持人及其所在单位负责人项目经费使用承诺制，按上一个项目经费进度情况确定下一个项目经费给付比例。实行督办考核制度，修订项目研发管理和奖励有关办法，专人督办项目执行，每半年通报工作进展，采取红、黄、绿灯挂牌警示督办措施，约谈序时进度较慢的项目负责人5人次，并将督查结果纳入年终绩效考核。2015年以来，9个应结题项目均按时结题，其中有6个项目提前申请验收或送审。
强化资源管理。创新选人用人机制，采取“强带弱、老带新、先进带后进”的“一对一”带教活动，选拔11名青年干部成为学科带头人和学科带头人培养对象；鼓励并支持7名专业技术人员在职继续深造，在事业单位开展技术中心技术总监选聘。优化仪器设备资源使用，开展实验室设备大清查和使用率分析，对15台（套）仪器设备重新分配利用，新购的325台价值2492.3万元仪器设备全部经由专家组论证，实现资源合理配置。强化社会服务能力提升，组织完成363个新项目研发，扩大认可检测资质范围，检测项目和检测标准同比分别增加25.1%和21.4%；积*开拓市场委托检测业务，首次中标海南省食品检验检测中心“2015年食品安全监督抽验和风险监测任务”项目，占项目全部资金的86.3%。
搭建学习平台。创办《海南检验检疫科技——求实与创新》期刊，及时反映海南检验检疫局科技工作动态，传递科技成果信息，刊登该局优秀科技论文及相关科技工作经验。截至目前已发行4期。以技术水平、创新程度、经济效益和社会效益等为指标，组织开展年度科学技术奖评审，共评出海南局“科技兴检奖”34项、优秀科技论文36篇，营造了科技队伍争当先进的良好氛围。2015年海南局获质检总局“科技兴检奖”三等奖项目3个、海南省“科技进步奖”三等奖1项，创历史新高。