我国地表水中含有68种抗生素，且浓度较高。珠三角已成典型抗生素污染区，连地下水都检出存在抗生素。
其中，珠江广州段受抗生素污染非常严重，红霉素、罗红霉素等9种常用抗生素总浓度*高超过每升水2000纳克。在其他流域，有些抗生素检出的浓度高达每升几百纳克，而工业发达的欧美国家则小于每升20纳克。
除了在河流中检出抗生素超标外，部分地区居民自来水中也被检出抗生素。比如在安庆、铜陵、阜阳、蚌埠等地，自来水中检出含有四环素、土霉素、金霉素、强力霉素、磺胺二甲基嘧啶等抗生素，南京自来水甚至检出阿莫西林等。
饮用水抗生素污染后，其危害*大，不但破坏了水质固有的天然成份，人饮用后甚至有可能引起中毒等反应；而且，长期饮用含有抗生素的水后，会增加人体对抗生素的耐药性，当前有效的抗生素药物以后可能逐渐失去其药效。
在强化对抗生素使用及排污监管的同时，重庆应**将对抗生素的检测纳入饮用水质量安全检测中，同时，积*促成国家及时修订生活饮用水水质标准指标，将对抗生素的检测纳入饮用水质量安全检测标准中。