2016年全师完成播种面积55万亩，同比略有下降，但预计棉花总产仍能稳定在10万吨。面积下降主因是36团今年不再种植棉花，改种黑枸杞等经济作物，另有个别棉田由于产量低，经济收益差改种香梨、红枣、饲草料、包谷和少量中药材等。
进入5月份以来，二师植棉地区气温变化很大，低温、阴雨天数偏多，影响了棉花的生长，截至5月底，农户反映现在棉花大多是6叶一蕊，*个别的有现蕾。特别是5月31日29团、30团遭受长达30多分钟的冰雹袭击，造成大面积棉田受灾，原本枝繁叶茂的棉苗被冰雹砸成光杆。29团的16连、19连，30团的5连、8连受灾尤为严重，据估算仅29团灾面积就达2万多亩。虽然遭受灾害天气袭击，但农户总体认为今年灾害相对较少，尤其是塔里木地区，棉花长势与往年基本持平，对后
2016年二师将29团、31团和33团作为良好棉花试点基地，在去年的基础上进一步强化棉花品种管理，加强品种布局，栽培管理力度。据调查，在良好棉花种植基地，二师以新陆中35为主栽品种，主栽品种严格控制在90%左右，辅助152 0173 3840和个别种子棉，以保证棉花品质的一致性。新陆中35为中晚熟品种，该品种成熟期大约在130天左右，能够有效避免出现2014年由于有效基温不够棉花迟迟不能成熟的情况。此外2016年二师还将在棉花采摘、运输、收购、加工环节严把质量关，进一步提高棉花质量。
