国家气象中心消息，2011年6月主要农业气象灾害为暴雨洪涝、干旱和风雹。其中，月内长江中下游沿江地区出现旱涝急转，致使部分地区棉花等农田被冲毁或受淹，农业设施受损或被毁，农业生产遭受一定损失。其它农业气象灾害包括热带风暴、高温和干热风、病虫害等，对农业生产影响较轻。
长江中下游地区（3～7日、9～11、13～15日、17～19日和23～25日）出现5次强降水过程，大部地区累计降雨量有300～500毫米，局部地区达800毫米，普遍比常年同期偏多5成至2倍。强降水有效补充了土壤水分和库塘蓄水，使前期干旱得到了缓解；但同时也导致湖北东部和西南部、安徽南部、江苏南部、江西北部、浙江北部等地的局部地区出现严重暴雨洪涝灾害，农业设施损毁，部分棉花等农田被冲毁或受淹；多雨寡照还导致受淹棉花长势偏差。据不完全统计，暴雨洪涝导致江西、湖南、湖北、浙江、安徽等省月内农作物受灾面积2096千公顷，绝收152 0173 3840千公顷。
6月上中旬，我国北方大部地区降水量不足50毫米，比常年同期偏少3～8成，加之气温偏高，导致土壤失墒较快，西北地区东部、华北南部、黄淮西部和南部出现轻至中度农业干旱，不利于春播作物生长和夏播作物播种出苗。下旬北方大部出现明显降水，农区干旱范围明显缩小、程度减轻，利于棉花现蕾。至月末，仅陕西北部、甘肃东北部、山西中南部、河南西北部墒情仍较差。据
6月全国共有23个省（市、区）相继遭受雷雨大风或冰雹袭击，其中河北、新疆等地局部受灾较重，累计农作物受灾面积超过350千公顷，绝收近65千公顷。大风冰雹造成局地棉花等被砸坏。 因风雹灾害导致农作物受灾面积统计数据显示，6月15日，新疆昌吉州、巴音郭楞、阿克苏、喀什、伊犁5地区（州）12个县（市、区）农作物受灾16.4千公顷，绝收4千公顷。
7月，东北地区东南部降水偏多，可能出现农田湿渍害；华北大部、黄淮、江淮北部、江汉降水偏多，可能出现多雨寡照天气，不利于棉花开花结铃和；江南大部气温偏高,长江中下游和江南北部等地高温日数（日*高气温≥35℃）较常年同期偏多2～4日。
