益生菌和纤维素，尤其是益生元纤维素，是Better-For-You产品中有助于消化系统健康和免疫的*有效成分，并以各自形式跻身功能性饮料成分行列（详情阅读：益生菌2.0时代：如何“消化”新蓝海）。
随着人们认识的不断加深，研发员也在更明确和清晰地区分什么是纤维素，什么不是纤维素。有利的如菊粉、低聚半乳糖、低聚果糖和抗性淀粉都被批准为纤维素，它们聚合度低（仅由20个以下的糖单元组成）更易溶解，对产品的结构影响也更小，有些还可用于纯净饮料。而对于完整纤维素，由于长链会引起粘度变化并产生不良纹理（如胶粘、砂砾或沙质感），所以研发员会限制它在饮料中的使用率。
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在科学支持下，益生菌的研究和治疗益处在不断扩大。超市里已出现很多益生菌产品，其中*常见的是发酵饮料，如开菲尔、酸奶饮料和非乳制品代替品。然而，目前很多饮料也在添加益生菌，如果汁饮料（包括益生菌康普茶，但发酵过程中会杀死大部分活的益生菌）等。
由于益生菌是活菌，它们仅适用于未经高温处理的饮料（因为超高温瞬时灭菌法（UHT）和巴氏灭菌法会杀灭所有嗜温营养细胞），这种产品通常在添加益生菌之前已经过温和的热处理，或不需要进行热处理。
而在热处理前加入益生菌也**挑战性，供应商正通过形成孢子的方式来克服它。虽然益生菌无法承受所有形式的UHT处理，但有些则能在巴氏灭菌后存活下来，并在进入消化道后发挥健康功能。
如同所有新兴科学领域一样，与其相关的法规还没有完全跟上，所以产品营销员和研发员应谨慎处理在包装等方面的宣称，原料供应商也应协助保证此类宣称的正确性。
GoodBelly益生菌制造商NextFoods的首席执行官Alan Murray说：“益生菌在饮料中已有一席之地”，这一说法也得到美国市场的有效支持。研究机构SPINS在2019年5月的《全球消化健康和益生菌市场展望》报告中称，有40%的消费者对益生菌饮料感兴趣，健康消化产品的年复合增长率达12%，这都表明消费者有强烈的购买需求。虽然人们在不断加深对益生菌与肠道健康关系的理解，但如何使消费者认识到益生菌饮料要持续饮用才能发挥效果，也是需要努力的方向。
