安徽省农业局在项目区品种推介、省级品种展示和专家评审的基础上，研究筛选出2008年棉花良种补贴项目主导品种29个。
具体品种如下：
杂交棉26个，为鄂杂棉11号、中棉所53（中杂003）、皖棉25（灵杂1号F1）、楚杂152 0173 3840（D152 0173 3840F1）、南农6号（南抗6号、GKz23）、冀杂6268、皖棉23（当杂1号F1）、皖棉26（东杂10号、升金棉10号）、泗杂3号、皖棉27（皖杂5号）、皖棉28（皖杂8号）、皖棉13（皖杂40）、南农9号（南农01-9，限沿江棉区）、皖棉31（全杂1号）、南农优3号（南优3号F1）、皖棉32（九杂6号）、丰裕8号、皖棉30（银丰-88）、皖棉24（皖杂3号F1）、鄂杂棉10号（太97d5-1、GKz33）、皖棉22（丰杂棉169）、科棉3号、皖棉18（淮杂2号）、湘杂棉8号（GKz17）、科棉6号（科杂棉133）、中棉所48（中0088F1）；常规棉3个，为皖棉37（绿亿棉7号、隆安棉2号）、皖棉34（HH6号）、灵选2号。
省农业局要求项目县（区、局）在品种推介的基础上，从发布的主导品种中正式选择补贴品种。原则上每个项目县（区、局）选择的补贴品种数量不超过5个。品种确定后，项目区要及时将品种面积分解落实到乡镇和村，并做好宣传推广、市场监管和项目区产销衔接等工作。
