在野生环境中自然生长发育、非人工栽培种植的茯苓,则为野生茯苓。野生茯苓一般生活在较老的松树林,或人工载种茯苓场附近的松林中,一年四季均可进行寻找采集。
生长有野生茯苓树桩周围的松树,有明显的枯萎或衰败迹象。有的树桩靠近地面处有白色或淡棕色的菌丝,揭开树根皮,可见黄白色浆液渗出。有的树桩烂后有黑褐色的横线裂纹。长有野生茯苓的树桩周围地面,常有白色或淡棕色的菌丝或菌丝膜状物。小雨后该地面干燥较快,并有不长草的地方和不规则的裂隙(俗称龟裂级),敲打此处地面会发出空响声。此时用探试器插入地下再拔出,若发现其上部有芋状块物或顶端沾有茯苓的粉末时,即可挖掘采集得到野生茯苓。
野生茯苓一般比人工培植的茯苓个小,但质地坚实、体重,浆汁较少。采挖的野生茯苓可加工成为药材(其产地加工方法与栽培茯苓相同),老产区采集的野生茯苓,多为家种茯苓菌丝蔓延生长遇到适宜的条件而结成的菌核。一般可用于扩大生产或做分离菌种使用。新产区采集的野生茯苓,一般不做菌种使用。