菌种鉴定及分析

百检网 2021-10-09
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菌种鉴定及分析

 菌种鉴定一般就只要提取基因组DNA,然后PCR扩增16srDNA片段,上GeneBank或者Eztaxon对比即可。一般序列相似度在97%以上就可以认为是同种细菌(当然也有例外,DNA序列仅仅是一个参考指标)。通过菌种基因测序,分析菌种基因片段,判断菌种种是否含有抗药性基因等。

检测项目

鉴定方法

涉及菌种

rDNA(核糖体DNA)序列分析

细菌、放线菌、酵母、霉菌

大型丝状真菌

功能基因分析

乳杆菌、双歧杆菌、肠球菌

pheS,gyrB,gyrA,atpD

芽孢杆菌

生理生化分析

细菌、放线菌、酵母

BioLog分析

细菌、酵母

API

细菌、酿酒酵母

形态学分析

霉菌

12分别与345组合

细菌、放线菌、酵母、霉菌

大型丝状真菌

G+C mol%含量测定

细菌、放线菌、酵母

脂肪酸组分分析

细菌、放线菌、酵母

DNA-DNA杂交

细菌、放线菌、酵母

*性脂

细菌、放线菌

呼吸醌

细菌、放线菌

电子显微镜

细菌、放线菌、酵母、霉菌

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 




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