2014年国家开始实施冰鲜水产品指定口岸制度，厦门东渡口岸首批成为总局冰鲜水产品指定口岸。当年进口台湾冰鲜水产品92批，重量556.53吨，货值94.61万美元，同比分别增长61.4%、157。56%、164.2%。随着福建自贸区厦门片区成立，东渡口岸对台优势更加凸显，冰鲜水产品逐年大幅增长。2015年进口105批1057.61吨，货值174.39万美元，同比分别增长14.13%、90.04%、84.33%。2016年1-10月冰鲜水产品进口量已超过去年全年。
东渡局采取多项措施保障冰鲜水产品快速通关。一是实行 检验检疫人员专岗专责，专职负责近期进口台湾水产品的施检工作，确保快速反应，做到船靠人到、货到即验。二是对不需送检的水产品，现场查验合格的，做到即验即放。三是对送检环节开辟送检绿色通道。提前与检测部门联系好送样事宜，做到即检即送、优先检测，减少送检待时、提高通关效率。
