2006年，卫生部通过中国疾病预防控制中心网络直报系统共收到全国食物中毒报告596起，中毒18063人，死亡196人，涉及100人以上的食物中毒17起。与2005年网络直报数据相比，食物中毒的报告起数减少4.03%，中毒人数减少0.86%，死亡人数减少48.56%。
据分析，2006年全国食物中毒报告起数和报告中毒人数的月份分布，与2005年相比，发生趋势基本一致，食物中毒的季节性比较明显。6~9月由于气温较高，适合细菌等微生物的生长繁殖，一旦食物储存、加工、食用不当，*易引起微生物性食物中毒；同时由于此时也正值各种野生植物和蔬菜采食期，如果缺乏相应的鉴别能力，*易误食引起食物中毒。微生物性食物中毒主要是由于食用了受细菌污染、腐败霉变的食品而引起，与食品加工、销售环节卫生条件差，公众的食品卫生意识淡薄等密切相关。有毒动植物食物中毒原因主要以四季豆、扁豆、菜豆等加热温度、时间不够和误食毒蘑菇、河豚鱼等有毒动植物为主。
从2006年的食物中毒分析结果看，食物中毒主要发生在农村地区、集体食堂、学生中。卫生部要求农村各级人民政府和有关部门要有针对性地加强上述重点地区、重点场所、重点人群的食品卫生知识宣传工作，提倡科学的生活方式和良好的饮食习惯，提高群众鉴别有毒动植物和有毒化学物质的能力，介绍预防食物中毒的有关知识，增强社会公众的食品安全意识，有效地减少食物中毒事件的发生。
