4月20日，历时4年，质检总局开发的中国电子检验检疫（e-CIQ）主干系统上线试运行。当天凌晨，北京奔驰汽车有限公司进口的一批风扇，成为中国电子检验检疫主干系统正式受理的**票货物。北京检验检疫局对这批货物完成审单、分单、施检等业务，两小时之内即出具入境通关单。当天，北京百麦食品加工有限公司出口的一票菠萝派，成为首票通过中国电子检验检疫主干系统办理通关业务的出口货物。根据企业要求，货物在属地获得通关单，在天津口岸放行。
截至4月20日中午，首批试点的京津冀三地检验检疫局，通过中国电子检验检疫主干系统共受理报检86批，其中北京局45批。该系统依托强大的数据、应用大集中技术模式，通过全面整合现有资源，高度集成系统数据和应用，形成了全流程、全业务、全覆盖的跨行政区、跨机构业务辖区的一体化全新监管模式。它重新整合了CIQ2000、集中审单、电子监管等18个在线运行系统的4000多个功能点，并与质检总局39个外接系统进行数据交互，将原检验检疫业务中40多个流程节点合并为23个。同时，对报检数据、体系监管数据、法律法规、工作手册等业务资源实现统一管理。
中国电子检验检疫主干系统的上线试运行，实现了质检总局对全国检验检疫业务统一决策、统一部署、统一指挥、统一管理、统一协调的综合管理。
2000年以来，中国电子检验检疫工作先后完成业务平台和网络建设，实现检验检疫与企业、检验检疫机构之间、检验检疫与海关等部门的数据交换，确定了以CIQ2000综合业务管理系统为基础，以电子申报、电子监管、电子放行为主要内容的中国电子检验检疫建设格局。然而，随着业务的发展，原有信息系统越来越不能满足检验检疫业务需要，主要存在核心业务系统覆盖不完整、信息系统繁杂、业务模式不统一、业务数据共享程度低、缺乏规范性和一致性等问题。
2012年7月25日，中国电子检验检疫主干系统项目启动，上千人次参与到系统建设中。2015年，质检总局口岸信息化工作会议提出：质检信息化建设要坚持集中统一、统筹管理的原则，认真抓好质检信息化建设规划，把信息化作为质检事业发展“十三五”规划的重中之重。
中国电子检验检疫主干系统基于“两地三中心”建设思路，采用“引擎+组件化”技术架构体系，通过3大功能域、17个功能子域，在原有核心业务系统功能的基础上，建立了统一规范的业务规则体系，新增出境集装箱适载检验、入境截获物等业务类型，实现风险管理、监督管理、注册备案、企业管理、实验室管理、业务资料、签证印章等功能。在整合系统功能、优化数据资源的同时，中国电子检验检疫主干系统还建立了完善的风险和监督管理机制，实现数据的智能化处理及全国检验检疫信息的共享共用；引入网络双线路、同城双活，异地灾备全新系统环境架构，确保业务不中断、数据零丢失；采用企业服务总线标准接口与外围系统进行数据交互，数据下发直属局，严控直属局系统数据回写，确保系统稳定运行、数据安全可靠。
作为首批上线试点运行的直属局，北京局先后完成15万字的培训教材编写工作；完成14个分支机构网络环境联调、3万多主干系统基础数据初始化工作；历时3个月，完成700多人次的业务人员培训考核；组织全局14个分支机构参加集中演练，配合质检总局完成27个外接系统联调测试工作；全面启动12个外挂系统改造工作，并开展系统验证测试，完成系统验证问题清单，配合项目组解决300多个系统问题。
中国电子检验检疫主干系统在京津冀正式上线试点运行，标志着其进入了*终的实际部署和应用阶段，困扰质检系统多年的各种数据和应用难题将会逐一解开。预计到2016年10月，中国电子检验检疫主干系统将在全国各直属检验检疫局上线。