常规理化指标：相对密度(比重)、水分(干燥失重)、灰分(灼烧残渣)、蛋白质(氮含量)、脂肪(粗脂肪)、脂肪酸组成、总碳水化合物、总糖、还原糖、葡萄糖、果糖、麦芽糖、蔗糖、乳糖、淀粉、粗纤维、膳食纤维、、总碱度(碱度)、总酸(酸度)、挥发酸、固定酸、有机酸、pH值、氨基酸态氮、挥发性盐基氮、硝酸盐、亚硝酸盐、亚硫酸盐(二氧化硫)、硫酸盐、氯化钠(氯化物、食盐、盐分)、亚氯酸盐、氯酸盐、溴酸盐、氰化物、酒精度、乙醇浓度、甲醇和**醇类、β-苯乙醇、总酯(酯类)、总醛(醛类)、浊度、泡持性、原麦汁浓度、干浸出物、酸价、过氧化值、羰基价、折光指数、碘值、皂化值、含皂量、不皂化物、残留溶剂、熔点、烟点、溶解度(溶解性)、固形物、杂质度、复水率、总硬度、偏硅酸、耗氧量、化学需氧量、电导率、氨氮、铵盐、、崩解时限、感官、净含量等；
元素(含重金属)：砷(砷盐、总砷、无机砷)、铅、铜、锌、镉、锡、总汞(汞、甲基汞)、氟(氟化物)、碘(碘化物)、氯(氯化物)、总磷(磷)、铁(铁盐)、镁、锰、钾、钠、钙、硒、铬、锑、镍、锗、铝、银、锶、锂、钡、钛(二氧化钛)、稀土等；
营养强化剂：维生素A、胡萝卜素、维生素B1(盐酸硫胺素)、维生素B2(核黄素)、维生素B6(盐酸吡哆醇)、维生素B12、维生素C(抗坏血酸)、维生素D、维生素E、维生素K1、烟酸和烟酰胺、叶酸、泛酸(泛酸钙)、生物素、肌醇、胆碱、氨基酸、胆固醇、咖啡因、茶多酚、牛磺酸、总皂甙、褪黑素、总黄酮、大豆异黄酮、花青素、大蒜素、芦荟甙、免疫球蛋白IgG等；
真菌毒素：黄曲霉毒素B1、黄曲霉毒素M1、黄曲霉毒素B1/B2/G1/G2、展青霉素、脱氧雪腐镰刀菌烯醇、玉米赤霉烯酮、赭曲霉毒素A、纳他霉素等；
微生物：菌落总数、(总)大肠菌群、耐热大肠菌群、大肠埃希氏菌、致泻大肠埃希氏菌、粪大肠菌群、粪链球菌、沙门氏菌、志贺氏菌、副溶血性弧菌、金黄色葡萄球菌、溶血性链球菌、产气荚膜梭菌、蜡样芽胞杆菌、霉菌和酵母、嗜渗酵母、乳酸菌、铜绿假单胞菌、阪崎肠杆菌、单增李斯特菌、商业无菌、双歧杆菌等；
农药残留：有机氯农药多组分残留量、有机磷农药残留量、氨基甲酸酯类农药多种残留等；
兽药残留：氯霉素、土霉素、四环素、金霉素、强力霉素、甲砜霉素、氟甲砜霉素、拉沙洛西钠、克伦特罗、己烯雌酚、磺胺二甲嘧啶、磺胺甲噁唑等；
食品添加剂：糖精钠、山梨酸、苯甲酸、叔丁基羟基茴香醚(BHA)、2,6-二叔丁基对甲酚(BHT)、特丁基对苯二酚(TBHQ)、对羟基苯甲酸酯类、没食子酸丙酯、合成着色剂、栀子黄、诱惑红、环己基氨基磺酸钠(甜蜜素)、丙酸盐、脱氢乙酸、乙酰磺胺酸钾(安赛蜜)、二十碳五烯酸(EPA)、二十二碳六烯酸(DHA)、过氧化苯甲酰、番茄红素、阿力甜、阿斯巴甜、纽甜、低聚果糖、叶绿素铜钠、双乙酸钠、1,2-丙二醇等；
有机污染物：三甲胺氮、丙二醛、苯并(a)芘、氯丙醇、甲醛、双乙酰、挥发性酚、阴离子合成洗涤剂、氯仿(三氯甲烷)、四氯化碳等； 非法添加物：苏丹红染料、碱性橙染料、孔雀石绿、结晶紫、次硫酸氢钠甲醛(吊白块)、滑石粉、硼酸、三聚氰胺等。