除了北疆受灾，今年南疆春播以来天气情况也较为多变。3月下旬早播棉花受到播种初期低温和降雨影响，4月8、9日的降雨也造成一定影响，近期全疆寒潮天气在南疆表现为大风沙尘，地膜被掀飞，土壤、种子被刮起，出苗棉花被打死……因此今年播种较早的棉田局部出现重播三次的情况，此次天气灾害也将造成一部分棉花重播。
总体看，近期全疆气象灾害将造成部分棉花重播，棉农需要果断决策，尽早重播，预计对整体产量不会造成太大影响，但农资方面的投入将有所增加。如果在5月中旬棉花定苗后继续出现灾害性天气，届时对棉花产量质量将造成一定影响。
农业专家也指出，近年来新疆在棉花播种期出现降雨的情况增多，这对地膜播种，尤其是南疆的覆土模式提出一定挑战。降雨后土壤中的盐分渗入膜下，造成次生盐渍化，棉苗水分渗出，造成枯萎。
