食品中微生物大概分为三类：食源性病源微生物、生产用微生物、造成食品变质腐败的微生物。
生产的微生物一般菌种特定，对人体无害，而有害微生物种类较多，危害较大，易引发食品安全事件，由微生物引发的食品安全问题占总量的 40%，因此我们在日常工作中应主要检测食品中有害微生物， 以保证食品安全。
一、前期准备：
检测人员进入无菌室进行检测工作之前必须做好前期准备工作，必须用消毒液或肥皂洗手消毒，然后在缓冲间更换无菌服、鞋，佩戴帽子、口罩、手套(或 70%乙醇多次擦拭双手)，避免对样品造成污染。
二、实验室环境：
食品微生物的检验工作对无菌室的环境要求严格，进行微生物检验工作的无菌室必须定期进行严格消毒，杀灭无菌室中的微生物。因为食品中微生物的检测项目大多在微生物实验室中，所以，对微生物实验室环境的控制非常重要。
检测人员需要保证在实验过程中，**应确保样品不被污染，其次应保证实验室内的微生物不能散到实验室外。 因此，实验室的无菌环境是保证微生物检测结果准确的基础。 微生物实验室应制定严格的规章制度， 保证检测人员无菌操作。
三、仪器维护：
实验仪器的维护保养对微生物检测的准确性至关重要。 实验室应制定仪器的检定校准和维护规程，在规定的时间对仪器进行检定、校准、维护保养， 保证检测结果准确可靠。
四、检测人员：
食品中微生物的检测是保障食品安全的重要环节，随着科技发展，检测技术的发展变化，食品微生物检测工作对检测人员提出了更高要求。
(一)需要检测人员不断学习新的检测标准和方法，提高检测的准度和精度;
(二)检测过程中使用的仪器设备、 化学试剂和不断变异的微生物对检测人员的身体健康造成危害，需要检测人员增强安全意识，严格遵守实验室的各项规章制度，做好个人防护，定期对无菌室进行消毒，妥善处理检测完毕的样品。
食品中微生物检测是食品检测重要分支，微生物生活也和我们生活息息相关。作为普通的消费者，我们要对变质有害食品加以分辨;作为检测行业从业人员，要时刻谨记职业道德，做好检测工作。
