1.机构定位不准，发展方向不明
作为政府计量行政部门设置的法定计量检定机构，主要职能是建立社会公用计量标准，组织量值传递，为法制计量提供技术保证。但目前有些地方不仅要求法定计量检定机构每年必须完成较高的经济指标，还要求每年必须递增多少个百分点。造成法定计量检定机构不是考虑如何科学合理地执行法定计量检定工作，而是每天为完成创收东奔西跑；有限的技术改造经费不是用于更新陈旧落后的社会公用计量标准，而是不断上新项目，追求新的经济增长点。还有相当一部分地、县级法定计量检定机构，量大、简单的(如集贸市场的衡器等)强检工作不愿意做，嫌费时费工来钱慢，而对大企业的非强检工作却情有独钟，种了别人的地，荒了自己的田。从体制上看，计量行政部门是公务员，计量技术机构是事业单位，财务上有的事业单位不在行政预算内，自收自支，并且政府投入少，计量技术能力落后于经济社会的发展，事业单位把创收作为自己的生存的首要前提，而不把为计量执法与行政许可提供支撑作为工作的方向，因为罚款上缴财政，不能为自身增加收入，使计量技术机构与行政职能逐渐脱节。
2.部门职能扩大，领导分工不同
计量工作从大的方面分为计量行政、计量技术两个方面，计量行政因管理性质的不同又分为计量管理与计量监督，计量管理主要涉及的是行政许可，计量监督则是行政执法处罚，另外还有计量技术机构。近几年，随着质监部门行政职能的扩大，内部分工越来越细。一些省市把计量工作分成计量许可、计量执法和计量技术机构三个部分，由三位领导分管，严重影响了计量工作的统筹发展、内部的协调配合，计量的整体作用发挥受到影响。造成了有的技术机构人员不懂计量法律、法规，只以收费指标作为工作考核标准，而不考虑为计量执法提供技术支撑；计量监督部门只抓罚款额度，对一些罚款收入较少的计量违法行为置之不理；还有的单位对计量授权等行政许可无规划，造成重复建设、资源浪费。
