虽然俗语“不干不净吃了没病”，但是“病从口入”也真是一个朴素真实的经验总结。食物可带给我们营养，同时食物的干净卫生是身体健康的重要保障。而食品微生物检测是衡量动植物性产品卫生质量的重要指标之一，也是判定被检产品能否食用的科学依据之一。
食品微生物检验主要是指细菌学检验，包括细菌总数、大肠菌群和致病菌的检验。经典的方法有固体培养基法（用于细菌总数的检验），液体培养基发酵法（用于大肠菌群的检验）服务范围：以及各类食品，植物性、动物性原材料、加工产品、半加工产品，如粮食、油脂、调味品、肉制品、饮料、罐头、饼干、糖果类、酒类、蔬菜、炒货、食品添加剂、农产品、婴儿食品、豆制品、糕点等
市场监管部门发布的食物抽检报告中，通常可以看到以下几个抽检项目：生物毒素超标问题；微生物污染问题；农兽药残留问题；重金属污染问题；食品添加剂超限量使用问题等。范围包括各类食品，植物性、动物性原材料、加工产品、半加工产品，如粮食、油脂、调味品、肉制品、饮料、罐头、饼干、糖果类、酒类、蔬菜、炒货、食品添加剂、农产品、婴儿食品、豆制品、糕点等。其中，根据我国卫生部颁布的中华人民共和国国家标准(GB)食品卫生检验方法-微生物部分，微生物检测主要有菌落总数、大肠菌群和致病菌3项。此外，微生物指标还包括病毒和寄生虫指标等。同时因为微生物检测涉及到菌落总数等细菌相关数据，在取样时就必须无菌采样，以免造成样品污染而使得检测结果出错。
食物无菌检测的主要程序包括(1)采集样品、(2)样品送检、(3)样品处理、(4)检验、(5)结果报告。在检验环节之前，每一个环节都有可能因为微生物进入而造成样品污染，因此无菌操作技术应贯穿整个检验过程，一旦其中一个环节没有采用无菌操作，那么其他环节的无菌操作也将没有任何意义。
样品检验完毕后，检验人员应及时填写报告单。检验人员和主管核实签字并加盖公章后，结果报告生效。如样品检验结果阳性，应按照规定保存时间保存。
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