人体内肠道微生物数量高达100万亿个,接近自身细胞总量的10倍,是人体的“第二基因组” ,也被称为“人体另一个器官” 。大量研究表明肠道菌群与糖尿病、肝脏疾病、心脑血管疾病、肾病、艾滋病、肿瘤等多种疾病密切相关,在?类健康和疾病中发挥着至关重要的作用。
肠道菌群通过产生的代谢物对人体产生影晌。 运用代谢组学检测肠菌代谢物的动态变化,清晰展示肠道菌群在宿主中的代谢状态,可更加直观的研究肠道菌群与疾病发生发展的关系,从而为疾病的预防和治疗,提高宿主的健康水平提供新的思路。
通过KEGG、BIOML、CGR、HBC、GMrepo等数据库结合文献及宏基因组深度测序数据,Biotree自主构建了肠道菌群代谢组数据库,覆盖2481个菌株,152 0173 3840个肠道菌群相关代谢物,不仅可有效对代谢物进?溯源分类,而且代谢物可精细溯源到具体菌株(部分为种属);将大大助力肠道菌群与健康作用机制研究。
技术优势
覆盖2481个菌种,152 0173 3840个肠道菌群相关代谢物,代谢物数量、菌株数量庞大;
不仅可对众多物种的代谢物进行溯源分类,而且代谢物可以溯源到菌株;
代谢物可以确定上下游关系(如果是可逆反应则无)及调控基因/酶。
技术路线
技术参数
样本要求
粪便、肠道内容物 200 mg /sample
血清、血浆 200 μL/sample
培养液 ≥200 μL/sample(推荐0.5mL/sample)
检测平台
UHPLC-QE-MS/UHPLC-QTOF-MS
应用方向
1、肠道菌群代谢物动态变化研究;
2、肠道菌群差异代谢物筛选;
3、肠道菌群在疾病发生发展中的作用机理研究。