与HACCP-EC-01相比，GB/T22000对食品安全管理体系的要求没有实质性的变化，主要是对标准进行了章节结构调整和文字的重新编辑，精练了标准的语言，使得标准的表述更加清晰合理，易于理解。
GB/T22000与HACCP-EC-01的之间的变化主要体现在如下方面：
1）HACCP-EC-01的文件名为《食品安全管理体系要求》，GB/T22000的文件名为《食品安全管理体系食品链中各类组织的要求》,两者名称上有差异；
2）GB/T22000修改了术语“3、8前提方案”的定义；“7、2前提方案（PRP(s)）”按照逻辑顺序重新组织了所阐述的内容，不再严格区分“基础设施和维护方案”与“操作性前提方案”。
3）GB/T22000不再含有“标准使用指南”的内容（HACCP-EC-01的附录A为“准则使用指南”）。该部分内容已纳入到ISO/TS22004：2005“Foodsafetymanagementsystems－GuidanceontheapplicationofISO22000：2005”。我国正在按照等同采用的原则将其转化为国家标准。
4）GB/T22000将原HACCP-EC-01中“7、9、1总则”的内容调整到了“7、1总则”中。该条款提出了安全产品的策划、实施和运行的总要求，适用于第7章的所有条款。
5）GB/T22000将原HACCP-EC-01中“7、9食品安全管理体系的运行”分为“7、9可追溯性系统”和“7、10不符合控制”两个条款。其中将原HACCP-EC-01中7、9、3～7、9、5的内容统一为“7、10不符合控制”，更加系统化。
6）GB/T22000调整了“8食品安全管理体系的确认、验证和改进”的结构，将原HACCP-EC-01的“8、4控制措施组合的确认”提前到“8、2控制措施组合的确认”，而原HACCP-EC-01的“8、2监视和测量”和“8、3食品安全管理体系的验证”的内容顺延到“8、3监视和测量的控制”和“8、4食品安全管理体系的验证”，逻辑顺序更合理。
7）GB/T22000的附录中增加了“GB/T22000-2006与GB/T19001-2000的对应关系”和“HACCP与GB/T22000-2006的对应关系”的内容。
ISO22000食品安全管理体系认证，申请需要提交以下资料：
1.认证申请书
2.营业执照和组织机构代码证复印件
3.卫生许可证复印件
4.生产许可证复印件（适用时）
5.其它法律证明文件复印件（适用时）
6.申证组织基本信息
7.执行的法律、法规、标准和规范清单
8.产品符合食品安全要求的证据
9.主要生产、检验设备清单
10.22000体系文件，包括：
1）手册、程序文件2）厂区和车间平面布置图3）生产工艺流程图4）水、气、人、物流图5）前提方案文件6）产品描述文件7）危害分析文件8）22000计划文件
11.多场所清单（适用时）
大致流程为：准备资料--提交申请--提交资料--安排审核--不符合整改--通过发证！
