土地污染主要表现在土壤酸化、有机质下降。中国工程院院士魏复盛说，南方土壤本多呈酸性，但因大量施用化肥，加上酸雨影响，导致酸度更进一步增加，一些地区土壤PH值平均下降0.5－0.7个PH单位，有的甚至下降2.1个PH单位，比如湖南强酸性土壤（PH值4.5－5.5）从20世纪80年代中期的49.13万公顷，到2006－2010年增加到145.67万公顷。
国家环保部、国土资源部近期发布“全国土壤污染调查公报”显示，全国土壤污染总的超标率为16.1%，其中轻微、轻度、中度、重度污染点位分别为12.1%、2.3%、1.5%和1.1%；我国适宜农业种植的一二类土壤占87.9%，存在潜在生态风险的占12.1%，其中属中度、重度污染的土壤约占3.0%。
土壤酸化、土壤有机质下降不利于对重金属络合固定。东北黑土区有机质已由开垦时的8%－10%下降到目前的2%－3%，有机肥施用普遍减少，导致土壤退化。
专家研究认为，多年来我国土壤污染加剧的原因主要在于化肥施用过量，以及农药使用过量和不科学、造成农残超标。1984年以来，我国化肥（氮肥、磷肥）用量持续增加，目前平均用量400千克每公顷，东部地区高的可达600千克每公顷，是世界公认警戒上限（225千克每公顷）的1.8倍以上，更是欧美平均用量的4倍以上。
此外，尽管近年我国淘汰、禁用了剧毒高残农药（有机氯、有机磷），新品种农药不断推出上市，使人畜中毒事件大幅下降，粮菜农残合格率上升，但目前我国农药用量仍是世界平均水平2倍，农业病虫害预警、预报科学合理用药的技术指导不足，采用绿色防治病虫害的方法，如物理的、生物的防治方法研究和推广不够，不能减少农药、抗生素、植物生长调节剂的使用。
土壤污染对农产品安全构成威胁。2013年，中国环境监测总站在蔬菜种植区采集4910个点位，发现超标点位1188个，占24.3%，其中轻微污染占16.8%，轻度污染占5.3%，中度、重度污染分别占2.1%和1.0%；重金属污染占17.5%，有机污染占7.9%，复合污染占1.3%。
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