近年来，由于植棉效益下降和经济社会发展的影响，内地棉农植棉积*性下降，种植面积大幅减少，据国家棉花市场监测系统统计，2016年全国植棉总面积在4384.5万亩，其中黄河流域植棉总面积在832.5万亩，同比下降24.8%，长江流域植棉总面积在574.5万亩，同比下降27.7%，新疆植棉总面积在2904.5万亩。内地“两河流域”和新疆地区植棉总面积达到4311.5万亩，占全国比重为98.3%，可见以上三地区是国内棉花生产*为重要的地区，而新疆则是重中之重。此次意见出台，再次明确了国内棉花生产格局，新疆为主，两河流域为补充。
此前内地棉花专业人士呼吁，鉴于内地棉花面积连续大幅下降，为了保证棉花供应数量和质量，稳定国内棉花供需，建议加大内地植棉支持力度，毕竟内地宜棉区还有广大土地可以利用。
从2014年开始，为了稳定棉花生产局面，国家出台了新疆棉花目标价格补贴政策，同时规定内地补贴范围覆盖山东、湖北、湖南、河北、江苏、安徽、河南、江西和甘肃9省，2014年度补贴标准为2000元/吨，以后年度的补贴标准以新疆补贴额的60%为依据，上限不超过2000元/吨。从补贴力度上来说，国家早已将新疆地区作为棉花生产的中心区了。
虽然补贴实施了三年，新疆地区成效显著，棉花面积和质量得到了保证，但是由于内地补贴标准低于新疆地区，棉农植棉收益有限。此次指导意见出台，能否提振内地棉农植棉情绪，改善植棉窘况还有待观察。
