此外，全区12个盟市局通过一般程序共立案查处各类案件6443件，食品案件4191件，药品案件1482件，保健食品65件，医疗器械案件279件，化妆品案件426件，罚没款4800余万元。移送司法机关55件，责令停产停业111家，吊销许可证12家，捣毁窝点15个，取缔无证经营196户。
“2016年案件查办工作呈现案件数量增加、大要案件取得突破、依法惩处力度不断加大的特点，”内蒙古食品药品监督管理局稽查局局长王月明说，其一，2016年比2015年的4753件增加了1749件，上升36.8%；其二，内蒙古食品药品稽查局查处了制售假冒茅台、五粮液等名酒、乳品企业自制氮气、制糖企业未取得许可自产自用食品添加剂、采用地坑腌制酸菜等数起具有行业潜规则性质或具有区域性食品安全隐患的大案要案；其三，全年向公安机关移送涉嫌犯罪59件，罚没款过亿元，责令停产停业111家，吊销许可证12家，捣毁窝点15个，取缔无证经营196户。
除此之外，该局进一步发挥12331食品药品投诉举报电话，推行举报奖励制度。2016年，内蒙古共受理食品药品投诉举报6121件，其中，电话5829件，网络68件，信件30件，走访85件，其他83件。针对投诉举报，按照“有诉必接、有接必查、有查必果、有果必复”的原则，全部进行调查处理并反馈投诉举报人。不少大案要案，其线索均来自投诉举报。全年，办结国家总局投诉举报中心转办的投诉举报件29件，办结率****。
