《办法》规定对小作坊实行属地管理，乡镇（街道协助县市场监管局开展小作坊“证照合一”登记、监督管理等工作。乡镇（街道食安办应当对辖区内小作坊申请人提供的材料进行审查，尤其要对生产经营场所有否违反“三改一拆”、“五水共治”等整治行动的规定进行审查；县市场监管局负责登记核查、发放营业执照以及日常的监督管理和执法检查。
为配合该《办法》的实施，县市场监管局出台了《关于实施〈仙居县食品生产加工小作坊“证照合一”登记管理办法〉的指导意见》，2个文件的公布实施将彻底解决小作坊规范难、取证难、监管难的三大问题。
