逐步建成的新疆优质棉花生产基地，促进了棉花产业快速发展和农民稳步增收。
２００１年启动的新疆优质棉花生产基地建设项目，到２００４年底共完成投资８．５３亿元，其中中央预算内专项资金４亿元，其余为自筹资金。４年间共建成３个棉花种子育种基地、一个生物技术育种中心、５个原种基地和３０个商品种子基地，使棉花良种率由过去的７０％提高到９０％以上。与此同时，新疆优质棉花生产基地还大面积引进以色列的滴灌技术，使中低产田的棉花单产提高１０％至２０％。
新疆优质棉花生产基地还在主产区配套建成１５个高产高效示范区，总面积达２０多万亩，平均亩产皮棉超过１２０公斤。此外，还在全区１２个生态区进行优质棉花无公害病虫测报监测站建设，组织国内外知名专家进行咨询和指导，建立了国内**的病虫害监测防治体系。
新疆优质棉花生产基地建设项目是我国针对国际棉花市场变化和国内棉纺工业发展，结合西部开发战略和农业结构调整而建设的重大项目。这一项目的初步建成，使新疆棉花品质和单产水平都有明显提高，其市场竞争力也不断增强。
